Objectifs
Fournir aux étudiants les concepts et techniques fondamentaux de la biostatistique et de l'épidémiologie de base nécessaires pour concevoir des études simples, analyser des données biomédicales à l'aide de logiciels et interpréter correctement leurs résultats, dans le cadre de la médecine fondée sur les preuves.
Prérequis
Recommandé : connaissances en mathématiques de niveau lycée.
Compétences
RC13. Être capable de concevoir et de mener des études statistiques simples à l’aide de logiciels, et d’en interpréter les résultats.
RC14. Comprendre et interpréter de manière critique des textes scientifiques.
RC15. Connaître et maîtriser les principes de la médecine fondée sur les (meilleures) preuves.
Acquis d'apprentissage
RK39. Connaître les concepts fondamentaux de la biostatistique et leur application aux sciences médicales.
RS8. Comprendre et interpréter les données statistiques présentes dans la littérature médicale.
RS9. Utiliser de manière autonome un ordinateur personnel.
RS12. Présenter en public, à l'oral et à l'écrit, des travaux scientifiques et/ou des rapports professionnels.
Description du contenu
Cours de base dispensant des contenus obligatoires sur la méthodologie statistique, les statistiques appliquées, l’épidémiologie de base et la médecine fondée sur les preuves. L’étudiant devra acquérir des compétences d’initiation à la recherche, notamment en matière de sources d’information, de nouvelles technologies et de bases de données.
SAVOIR :
1. Connaître les concepts fondamentaux de la biostatistique et leur applicabilité aux sciences biomédicales.
2. Concevoir et analyser des études simples.
3. Connaître les principales techniques statistiques et leur application.
4. Utilité et applications des logiciels statistiques.
5. Distinguer un échantillon d'une population, ainsi que les échantillons aléatoires des échantillons non aléatoires.
6. Analyser de manière descriptive un ensemble de données.
7. Connaître les distributions les plus importantes et savoir quand les utiliser.
8. Construire et interpréter des intervalles de confiance pour les moyennes et les proportions.
9. Formuler les hypothèses d’un test en fonction de l’objectif de l’expérience, connaître leurs limites et leur interprétation.
10. Connaître la relation entre les intervalles de confiance et le test d'hypothèse.
11. Interpréter la valeur P et en tirer des conclusions.
12. Distinguer les échantillons indépendants des échantillons appariés.
13. Distinguer les méthodes paramétriques des méthodes non paramétriques.
14. Tester une ou deux moyennes ou proportions en fonction du type et du nombre de données.
15. Connaître les applications du test du chi carré, comprendre les limites de cette technique et analyser les causes de sa signification.
16. Connaître les concepts de facteur de risque, de risque relatif, de rapport de cotes et de fraction étiologique.
17. Le problème des comparaisons multiples et la correction de Bonferroni.
18. Connaître le concept et l’interprétation des études de régression et de corrélation linéaire simple.
19. Connaître le concept et l’interprétation de l’analyse de survie. Méthode de Kaplan-Meier.
20. Connaître le concept, l’objectif et la conception d’un essai clinique. Méta-analyse.
21. Médecine fondée sur les preuves.
COMPÉTENCES PRATIQUES :
1. Interpréter les niveaux de précision, de confiance et d’erreur dans les conclusions d’une étude statistique.
2. Utiliser un logiciel de statistiques au niveau de l'utilisateur.
3. Analyser des données de manière descriptive.
4. Calculer des intervalles de confiance pour les moyennes et les proportions, en déterminant la taille adéquate de l'échantillon.
5. Formuler les hypothèses d'un test d'hypothèse.
6. Calculer la valeur P.
7. Comparer deux moyennes.
8. Comparer deux proportions.
9. Analyser un tableau de contingence à l'aide du test du chi carré.
10. Appliquer la méthode de Bonferroni.
11. Obtenir le nuage de points, la droite de régression et la corrélation dans le cas de deux variables.
12. Calculer le coefficient de corrélation de Spearman.
13. Créer une base de données.
14. Utiliser de manière autonome un ordinateur personnel et les logiciels les plus courants dans le domaine médical.
Avoir mis en pratique les compétences suivantes sous la supervision d’un tuteur :
1. Décomposer des tableaux de contingence pour rechercher les causes de la significativité d’un test du chi carré.
2. Transformer des variables afin de vérifier les spécifications du modèle à utiliser.
3. Obtenir des intervalles de normalité dans une régression linéaire.
4. Calculer la mesure appropriée dans une étude épidémiologique.
5. Évaluer une méthode de diagnostic binaire. Réaliser des tests exacts pour deux proportions.
6. Comparer plusieurs moyennes à l'aide de méthodes paramétriques et non paramétriques.
7. Réaliser une régression multiple.
8. Utiliser de manière autonome un ordinateur personnel et les logiciels médicaux les plus courants.
Contenu :
BLOC I. INTRODUCTION ET STATISTIQUE DESCRIPTIVE
˗ UNITÉ 1 : Méthode scientifique et statistique. Essais cliniques et méta-analyses.
˗ UNITÉ 2 : Population et échantillon. Caractéristiques. Classification et description des caractères. Types de variables.
˗ UNITÉ 3 : Les questionnaires : variables et échelles de mesure. La mesure en milieu clinique.
˗ UNITÉ 4 : Variables qualitatives : distribution de fréquences et représentation graphique.
˗ UNITÉ 5 : Variables quantitatives : mesures de centralité, de position, de dispersion et de forme. Représentation graphique.
BLOC II. PROBABILITÉ
˗ UNITÉ 6 : Probabilité et attribution des probabilités.
˗ UNITÉ 7 : Probabilité conditionnelle. Théorème de Bayes. Diagnostic clinique. Sensibilité, spécificité et courbes ROC.
BLOC III. DISTRIBUTIONS DE PROBABILITÉ
˗ UNITÉ 8 : Variables aléatoires : fonction de probabilité, densité et distribution.
˗ UNITÉ 9 : Distributions discrètes importantes : binomiale et de Poisson.
˗ UNITÉ 10 : Distributions continues notables : la distribution normale et ses applications. Approximation entre distributions.
BLOC IV. ESTIMATION ET INTERVALLES DE CONFIANCE.
˗ UNITÉ 11 : Schéma général de l'inférence : échantillonnage, biais et théorème de la limite centrale. Tests statistiques.
˗ UNITÉ 12 : Estimation d’une moyenne : estimation ponctuelle et intervalle de confiance. Taille de l’échantillon.
˗ UNITÉ 13 : Estimation d’une proportion : intervalle de confiance. Taille de l’échantillon.
BLOC V. TEST D'HYPOTHÈSES. COMPARAISONS ET MODÈLES.
- UNITÉ 14 : Introduction au test d’hypothèses. Test de la moyenne d’une population.
- UNITÉ 15 : Test de la moyenne de deux populations.
- UNITÉ 16 : Comparaison de deux moyennes : échantillons indépendants et appariés. Tests paramétriques et non paramétriques.
- UNITÉ 17 : Comparaison de deux proportions. Tableaux de contingence : test du chi carré. Correction de Bonferroni et puissance statistique.
˗ UNITÉ 18 : Régression linéaire, corrélation et ANOVA.
- UNITÉ 19 : Médecine fondée sur les preuves.
Activités de formation
1. Cours magistraux : Explication des fondements théoriques de la méthode statistique, des statistiques appliquées et de l’épidémiologie de base, à l’aide d’outils informatiques et de ressources audiovisuelles. 45 heures (45 heures en présentiel).
2. Séminaires spécifiques : résolution d’exercices et de problèmes appliqués portant sur les contenus abordés lors des cours magistraux, avec la participation active des étudiants et une discussion collective des résultats. Présentation, étude et discussion de cas ou de travaux. Exposition des travaux. Discussion sur des articles de vulgarisation. 10 heures (10 heures en présentiel).
3. Travaux pratiques en laboratoire : utilisation de logiciels statistiques pour l’analyse descriptive et inférentielle d’ensembles de données, sous la supervision des enseignants. 10 heures (10 heures en présentiel).
4. Tutorats individuels : séances d’accompagnement personnalisé, sur rendez-vous, destinées à répondre aux questions et à assurer le suivi du processus d’apprentissage de l’étudiant. 1 heure (1 heure en présentiel).
5. Examens : Épreuves d'évaluation des contenus théoriques et des travaux pratiques en laboratoire. 4 heures (4 en présentiel).
6. Travail personnel : étude des contenus théoriques et pratiques, résolution d’exercices supplémentaires et consultation de la bibliographie recommandée. 105 heures (0 en présentiel).
Total : 175 heures (70 en présentiel).
Système et critères d’évaluation
SE1 : Évaluation objective par les enseignants au moyen d’un examen final de la matière et d’un examen partiel : 70 %
SE2 : Évaluation de l’assiduité et de la participation de l’étudiant en cours : 5 %
SE3 : Évaluation des travaux pratiques de laboratoire par le biais d’un examen ou de la remise des travaux pratiques : 15 %
SE4 : Évaluation des travaux individuels et/ou collectifs par la remise et/ou la présentation du travail : 10 %
Calendrier
Cliquez sur ce lien pour obtenir le calendrier détaillé au format Excel
| Session |
Activité |
Description |
Évaluation |
| 1 |
MG |
Présentation du cours |
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| 2 |
MG |
UNITÉ 1 : Méthode scientifique et statistique. Essais cliniques et méta-analyses. |
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| 3 |
MG |
UNITÉ 2 : Population et échantillon. Caractéristiques. Classification et description des caractères. Types de variables. |
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| 4 |
MG |
UNITÉ 2 : Population et échantillon. Caractéristiques. Classification et description des caractères. Types de variables. |
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| 5 |
MG |
UNITÉ 3 : Les questionnaires : variables et échelles de mesure. La mesure en milieu clinique. |
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| 6 |
MG |
UNITÉ 3 : Les questionnaires : variables et échelles de mesure. La mesure en milieu clinique. |
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| 7 |
MG |
UNITÉ 4 : Variables qualitatives : distribution de fréquences et représentation graphique. |
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| 8 |
MG |
UNITÉ 4 : Variables qualitatives : distribution de fréquences et représentation graphique. |
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| 9 |
MG |
Révision |
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| 10 |
MG |
UNITÉ 5 : Variables quantitatives : mesures de centralité, de position, de dispersion et de forme. Représentation graphique. |
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| 11 |
MG |
UNITÉ 5 : Variables quantitatives : mesures de centralité, de position, de dispersion et de forme. Représentation graphique. |
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| 12 |
SM |
Exercices I : Résolution d'exercices de statistiques descriptives. |
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| 13 |
MG |
UNITÉ 6 : Probabilité et attribution des probabilités. |
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| 14 |
MG |
UNITÉ 6 : Probabilité et attribution des probabilités. |
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| 15 |
MG |
UNITÉ 7 : Probabilité conditionnelle. Théorème de Bayes. Diagnostic clinique. Sensibilité, spécificité et courbes ROC. |
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| 16 |
MG |
UNITÉ 7 : Probabilité conditionnelle. Théorème de Bayes. Diagnostic clinique. Sensibilité, spécificité et courbes ROC. |
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| 17 |
MG |
UNITÉ 8 : Variables aléatoires : fonction de probabilité, densité et distribution. |
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| 18 |
SM |
Exercices II : Résolution d'exercices de statistiques descriptives |
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| 19 |
MG |
UNITÉ 9 : Distributions discrètes importantes : binomiale et de Poisson. |
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| 20 |
MG |
UNITÉ 9 : Distributions discrètes importantes : binomiale et de Poisson. |
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| 21 |
MG |
UNITÉ 8 : Variables aléatoires : fonction de probabilité, densité et distribution. |
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| 22 |
MG |
UNITÉ 10 : Distributions continues importantes : la distribution normale et ses applications. Approximation entre distributions. |
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| 23 |
SM |
Exercices III : Résolution d'exercices sur les probabilités |
|
| 24 |
MG |
Examen partiel (contenus jusqu’à l’unité 6) |
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| 25 |
MG |
UNITÉ 10 : Distributions continues notables : la distribution normale et ses applications. Approximation entre distributions. |
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| 26 |
MG |
UNITÉ 11 : Aperçu général de l'inférence : échantillonnage, biais et théorème central de la limite. |
|
| 27 |
MG |
UNITÉ 11 : Aperçu général de l'inférence : échantillonnage, biais et théorème central de la limite. |
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| 28 |
MG |
UNITÉ 13 : Estimation d’une proportion : intervalle de confiance. Taille de l’échantillon. |
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| 29 |
MG |
UNITÉ 12 : Estimation d'une moyenne : estimation ponctuelle et intervalle de confiance. Taille de l'échantillon. |
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| 30 |
SM |
Exercices IV : Résolution d'exercices sur les distributions de probabilité |
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| 31 |
MG |
UNITÉ 13 : Estimation d'une proportion : intervalle de confiance. Taille de l'échantillon. |
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| 32 |
MG |
UNITÉ 14 : Introduction au test d'hypothèse. Test de la moyenne d'une population. |
|
| 33 |
MG |
UNITÉ 14 : Introduction au test d'hypothèse. Test de la moyenne d'une population. |
|
| 34 |
MG |
UNITÉ 12 : Estimation d'une moyenne : estimation ponctuelle et intervalle de confiance. Taille de l'échantillon |
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| 35 |
MG |
UNITÉ 14 : Introduction au test d'hypothèse. Test de la moyenne d'une population. |
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| 36 |
SM |
Exercices V : Résolution d'exercices sur les distributions de probabilité |
|
| 37 |
MG |
UNITÉ 15 : Comparaison des moyennes de deux populations |
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| 38 |
MG |
UNITÉ 15 : Comparaison des moyennes de deux populations |
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| 39 |
MG |
UNITÉ 19 : Médecine fondée sur les preuves |
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| 40 |
MG |
UNITÉ 16 : Comparaison de deux moyennes : échantillons indépendants et appariés. Tests paramétriques et non paramétriques. |
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| 41 |
MG |
UNITÉ 16 : Comparaison de deux moyennes : échantillons indépendants et appariés. Tests paramétriques et non paramétriques. |
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| 42 |
SM |
Exercices VI : Résolution d'exercices sur les distributions de probabilité |
|
| 43 |
MG |
UNITÉ 16 : Comparaison de deux moyennes : échantillons indépendants et appariés. Tests paramétriques et non paramétriques. |
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| 44 |
SM |
Exercices VII : Résolution d'exercices sur le test d'hypothèses |
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| 45 |
LB |
Statistiques descriptives et probabilité conditionnelle. Tableaux de contingence. |
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| 46 |
LB |
Intervalles de confiance et tailles d'échantillon. |
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| 47 |
LB |
Association de variables qualitatives : test d'hypothèses et variables quantitatives. |
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| 48 |
MG |
UNITÉ 17 : Comparaison de deux proportions. Tableaux de contingence : test du chi carré. Correction de Bonferroni. |
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| 49 |
LB |
Association entre variables quantitatives. Évaluation des travaux pratiques (remise des travaux pratiques) |
15 |
| 50 |
MG |
UNITÉ 17 : Comparaison de deux proportions. Tableaux de contingence : test du chi carré. Correction de Bonferroni. |
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| 51 |
MG |
UNITÉ 17 : Comparaison de deux proportions. Tableaux de contingence : test du chi carré. Correction de Bonferroni. |
|
| 52 |
MG |
UNITÉ 18 : Régression linéaire, corrélation et ANOVA. |
|
| 53 |
MG |
UNITÉ 18 : Régression linéaire, corrélation et ANOVA. |
|
| 54 |
MG |
UNITÉ 18 : Régression linéaire, corrélation et ANOVA. |
|
| 55 |
SM |
Exercices VIII : Résolution d'exercices sur le test d'hypothèse |
|
| 56 |
MG |
UNITÉ 18 : Régression linéaire, corrélation et ANOVA. |
|
| 57 |
MG |
Révision |
|
| 58 |
SM |
Exercices IX : Résolution d'exercices sur le test d'hypothèse. Analyse de survie. |
|
| 59 |
SM |
Exercices X : Résolution des derniers exercices et questions. Remise et soutenance des travaux individuels et/ou collectifs |
10 |
| 60 |
CN |
Tutorat de suivi du processus d'apprentissage (date à déterminer, à la demande de l'étudiant). Évaluation de l'assiduité et de la participation |
5 |
| 61 |
EV |
Examen final du cours (date officielle selon le calendrier des examens, non incluse dans le planning pédagogique) |
70 |
Bibliographie
Bibliographie de base :
1.- Martínez González, Miguel Ángel, éditeur ; Sánchez-Villegas, Almudena ; Toledo Atucha, Estefanía ; Faulín Fajardo, Francisco Javier
La biostatistique à la portée de tous
5e éd. Elsevier. 2025.
ISBN : 9788413829821
http://sapiens.uax.com/discovery/fulldisplay?docid=alma99922055803591&context=L&vid=34UAX_INST:34UAX_V1&lang=es&search_scope=MyInst_and_CI&adaptor=Local%20Search%20Engine&tab=Everything&query=any,contains,biostatistique&sortby=date_d&facet=frbrgroupid,include,9001610310540091269&offset=0